理工学研究科

• 生産環境工学専攻（機械工学コース）
• 生産環境工学専攻（環境建築コース）
• 生産環境工学専攻（船舶工学特別コース）
• 物質生命工学専攻（機能材料工学コース）
• 物質生命工学専攻（応用化学コース）
• 電子情報工学専攻（電気電子工学コース）
• 電子情報工学専攻（情報工学コース）
• 電子情報工学専攻（ICTスペシャリスト育成コース）
• 数理物質科学専攻（数理科学コース）
• 数理物質科学専攻（物理科学コース）
• 数理物質科学専攻（地球進化学コース）
• 環境機能科学専攻（分子科学コース）
• 環境機能科学専攻（生物環境科学コース）
• アジア防災学特別コース
• 先端科学特別コース

農学研究科

• 食料生産学専攻(農業生産学コース)
• 食料生産学専攻(植物工場システム学コース)
• 食料生産学専攻(食料生産経営学コース)
• 食料生産学専攻(地域イノベーションコース)
• 食料生産学専攻(水圏生産学コース)
• 食料生産学専攻(知能的食料生産科学特別コース（6年一貫）)
• 生命機能学専攻（応用生命化学コース）
• 生命機能学専攻（健康機能栄養科学特別コース（6年一貫））
• 生物環境学専攻（森林資源学コース）
• 生物環境学専攻（森林環境管理学サブコース）
• 生物環境学専攻（バイオマス資源学コース）
• 生物環境学専攻（地域環境工学コース）
• 生物環境学専攻（環境保全学コース）
• 生物環境学専攻（水環境再生科学特別学コース（6年一貫））

連合農学研究科

• 生物資源生産学専攻
• 生物資源利用学専攻
• 生物環境保全学専攻